Si el núcleo interfiere en la producción del PHA, entonces la concentración intracelular de estos polímeros va a estar medida por los genes y la forma en que estos son expresados para producir proteínas que modulen la condensación de moléculas de acetil-CoA, así como la polimerización de ésteres de ácido hidroxialcanoicos.

Tabla: Genes y proteínas que regulan la producción de polihidroxialcanoato en bacterias.

SCL: polímero de cadena corta

MCL: polímero de cadena larga